Конструирование антимикробного пептида

УДК 543.645.6

Авторы:

Тихонов С.Л., 

Тихонова Н.В.,

Уральский государственный аграрный университет (Екатеринбург, ул. Карла Либкнехта, д. 42)

Аннотация. Создан новый антимикробный пептид на основе имеющегося натурального пептида. В качестве объекта исследований использован нативный пептид со следующей аминокислотной последовательностью PAFAASSSKA. Общее гидрофобное соотношение, определяемое APD = 50%. заряд + 1, гидрофобность пептида по Уимли-Уайту на уровне 1,38. Молекулярная масса входного пептида равна 936,029. Согласно базе данных APD на основе известного пептида создан новый антимикробный пептид со следующей последовательностью: PDPAKTAPKKGSKKAVTKA, который наиболее близок к известному АМП AP00338.

Ключевые слова: базы данных, антимикробный пептид, конструирование, аминокислотная последовательность, молекулярная масса.

Скачать полный текст статьи